对邪马台国的研究始于江户时代中叶。新井白石和本居宣长对《魏志》中日本人的记载进行了详细研究，分别提出了邪马台国在首都大和九州的说法，并对卑弥呼是否是神功皇后进行了深入研究。
明治维新后，日本历史学界肯定了日本人记载的历史资料的价值，形成了两个学派，主张邪马台国在九州和首都大和，否认了卑弥呼是神功皇后的传统说法。
第一次世界大战前后，考古学家和马克思主义历史学家参加了讨论，对邪恶马台国的社会性质进行了理论研究和阐述，扩大了研究领域。
第二次世界大战后，邪马台国的研究发展迅速。然而，在地理位置问题上，九州在里程和方向上的矛盾仍然无法解决，因此在社会性质和国家理论上存在不同的讨论。
因此，关于邪恶马台国的社会，有各种观点，如原始社会的末期、英雄时代、从原始社会到阶级社会的过渡阶段和奴隶制社会。在国家理论上，也有各种观点，如部落联盟、国家的原型或原始国家以及东方专制君主制。
2009年3月20日，日本奈良县樱井市教育委员会宣布，公元3世纪上半年发现了该市缠绕遗迹的考古发掘建筑群。这一发现可能成为探索日本国家起源的“邪马台国”的新线索。
缠绕遗迹被认为是“邪马台国”在首都最有可能的地方，以前已经被多次挖掘过。2009年2月开始的调查扩大了1978年发掘的栅栏和建筑遗迹及其周边约400平方米的范围，发现了新的建筑和栅栏遗迹。这些建筑和栅栏的时代是公元3世纪上半年，与魏志日本传记中卑微的时代一致。
发掘出来的建筑只是排成一排，被栅栏隔开。樱井市教委表示，这种结构在同一时期的考古发现中还是第一次，很可能是“王权中心设施的一角”。
一些支持首都的学者认为，这次发现的建筑规模较小，应该是“中心设施”的附属设施，未来的探索令人期待。一些学者注意到了建筑群的规划，认为这可能是整顿“国家威望”以迎接魏国使者的结果。
然而，一些支持九州理论的学者认为，仅仅依靠少量的建筑和栅栏遗迹就认为这是一个“邪恶的马台国”，这一发现并不能动摇九州理论。
通过科学检测，日本考古学家发现奈良县樱井市筷子墓出土的文物与日本古代“邪马台国”女王卑弥呼的死亡时间一致。这一发现可能对确定“邪马台国”作为日本国家起源的地位产生重要影响。
据日本媒体2009年5月29日报道，日本国家历史民俗博物馆的一个研究小组利用碳14年法测试了附着在筷子坟墓周围出土的土器上的碳化物。根据出土状态，考古学家判断这些土器是古墓完工后不久丢弃的，其年龄也应与古墓建造时代相似。根据检测结果，研究小组推定，筷墓古墓的建造年龄在公元240年至260年之间。这与中国古代史书中记载的卑弥呼的死亡时间约为248年。因此，研究小组认为筷墓古墓很可能是卑弥呼的陵墓。
筷墓古墓位于公元3世纪日本最大的村落遗迹中，全长约280米，远远大于之前发现的110米。它被认为是强大政权的结果，但它的主人一直是个谜。由于筷墓古墓是日本宫内厅指定的皇陵，不允许发掘，因此古墓周围出土的土器成为判断古墓时代的线索。之前的研究基本上是根据土器的风格进行的，包括卑弥呼自己的陵墓、卑弥呼后继者的陵墓和与卑弥呼无直接关系的陵墓。
“邪马台国”被认为是日本国家的起源，其记载见于中国史书《三国志》中的《魏志日传》。书中称“邪马台国”在大乱后产生了一位名叫卑弥呼的女王，并记载了公元239-248年卑弥呼统治下“邪马台国”与魏国互派使节的情况。但关于“邪马台国”的地位，书中并没有准确记载，史学界一直有两种意见：畿道地区和九州地区。日本媒体认为，上述考古成果很可能会影响“邪马台国”的地位之争。
一些学者指出，碳14年度测试方法在取样过程中容易混合杂质，影响测试结果。从世界考古实践的角度来看，测试结果往往高于考古学认定的时代，因此不能轻易得出结论。但研究小组声称，除了筷子坟墓外，他们还测试了周围古墓出土的土壤工具，结果是相同的。
邪马台国真的存在吗？有什么证据证明它存在？